Cada año, del 15 de Junio al 15 de Septiembre tiene lugar la Operación Tránsito, conocida por Operación Paso del Estrecho (O.P.E.) por la cual miles de magrebíes regresan a sus países de origen por vacaciones.
En la Operación participan diversos Organismos: Autoridad Portuaria, Capitanía Marítima, Protección Civil, Policía, Cruz Roja, Guardia Civil, S.A.S., Salvamento Marítimo, etc.
El Puerto de Almería es el segundo en importancia después de Algeciras, y cada año aumenta su cuota de mercado. Son más de 650.000 pasajeros y 160.000 vehículos los que pasaron por Almería en la OPE 2005, lo que supone más del 24,26% del total de viajeros OPE.
Durante al OPE 2005 hubo 8 buques en líneas regulares: 5 buques con Nador (Marruecos), 1 con Melilla, 1 con Alhucemas (Marruecos) y Ghazaouet (Argelia). Se mantienen los niveles de afluencia de años anteriores.
Como mejoras más destacadas podemos mencionar: el cumplimiento de los horarios de salida de los barcos mediante el control del horario de embarque, claridad y calidad de intercambio de información con el Puerto de Nador, instalación de pivotes neumáticos que controlan el acceso a los embarques, habilitación de nuevas sombras y mayor número de unidades de aseos portátiles.

Plano: